All'asse II spettano il 35% delle risorse.
Il macro-obiettivo del 'miglioramento dell'ambiente e dello spazio rurale' sarà raggiunto concentrando gli interventi nella conservazione della biodiversità e nella protezione dei sistemi forestali ad alto valore naturale, nonché nella salvaguardia qualitativa e quantitativa delle risorse idriche superficiali e profonde.
Altri obiettivi di asse riguardano la riduzione dei gas serra, la salvaguardia del paesaggio rurale, la difesa del territorio contro i dissesti idrogeologici e la promozione del mantenimento delle attività agricole nelle zone svantaggiate.
La priorità delle risorse dell'asse II è stata data all' 'agroambiente' (56,7%), seguito dagli 'investimenti non produttivi' (17,2%).
L'Asse II si compone di 9 Misure, tra queste sono state attivate le seguenti